قال الشيخ الحر في تذكرة المتبحرين (٩٣٩): «مولانا ميرزا رفيع الدين محمد النائيني، فاضل، عالم، جليل [عظيم الشأن حكيم متكلم، ماهر، له كتب منها: شرح الكافي، وهو من المعاصرين، نروي عن مولانا محمد باقر المجلسي عنه».